1986年6月门诊部开张，12月妇科、产科开张，病床18张，总建筑面积1980平方米。

        1994年5月卫生部、国际卫生组织、联合国儿童基金会认定我院为“爱婴医院”。

        1997年6月妇幼保健所与妇幼保健院合并。

        2001年率先成立全市第一家新生儿科、新生儿重症监护病房，同年被评为市级重点学科；12月江苏省卫生厅授予“省新生儿疾病筛查中心盐城分中心”。

        2005年7月成立盐城市首家儿外科病房。

        2007年“开发区分院社区服务中心”挂牌。

        2008年7月成为上海市第一妇婴保健院盐城协作医院。

        2009年4月成为盐城卫生职业技术学院教学医院；5月成为苏州大学医学部教学医院。

        2010年2月青年路分院运行，4月PICU、儿童心脏病治疗中心挂牌；5月成为安徽医科大学教学医院。

        2012年7月成为盐城卫生职业技术学院教学医院、附属医院。

        2015年4月成为扬州大学医学院附属医院；通过国家级住院医师规范化培训基地协同医院（妇产科、儿科专业）评估。

        2016年1月成立江苏省人民医院“王水工作室”；11月合并了市妇幼保健机构与计划生育服务机构，组建市级妇幼健康服务机构，增挂“妇幼保健计划生育服务中心”。

        2017年10月成为复旦大学附属儿科医院定点合作单位，上海市红房子妇产科医院技术协作单位；12月成立了南京市儿童医院小儿呼吸内科“赵德育”博士工作室。

        2018年2月，荣获江苏省妇幼健康服务工作突出贡献集体三等功；儿科成功创建为“省级临床重点专科”；11月成功对接“上海红房子妇产医院—徐丛剑教授工作室”。

        2019年4月成立中大医院任慕兰名医工作室；成为首批“江苏省儿童早期发展基地”。

        2019年7月，医院整体搬迁至新院区，盐城市世纪大道31号。

        2020年1月，顺利通过江苏省三级甲等妇幼保健院复核评审。

        2020年2月20日，我院十名护士组成的驰援湖北医疗队出征。